详解如何利用Cython为Python代码加速

yipeiwu_com6年前Python基础

引言

通常,在 Python 中写循环(特别是多重循环)非常的慢,在文章 /post/133807.htm中,我们的元胞自动机的状态更新函数 update_state 使用了两重循环,所以我们尝试用 Cython 重构该方法。

代码

我们在同文件夹下新建一个 update.pyx 文件,写入如下内容

import numpy as np 
cimport numpy as np 
cimport cython


DTYPE = np.float
ctypedef np.float_t DTYPE_t

def update_state(np.ndarray[DTYPE_t, ndim=2] cells):
  return update_state_c(cells)

@cython.boundscheck(False)
@cython.wraparound(False)
cdef np.ndarray[DTYPE_t, ndim=2] update_state_c(np.ndarray[DTYPE_t, ndim=2] cells):
  """更新一次状态"""
  cdef unsigned int i
  cdef unsigned int j

  cdef np.ndarray[DTYPE_t, ndim=2] buf = np.zeros((cells.shape[0], cells.shape[1]), dtype=DTYPE)
  cdef DTYPE_t neighbor_num
  for i in range(1, cells.shape[0] - 1):
    for j in range(1, cells.shape[0] - 1):
      # 计算该细胞周围的存活细胞数
      
      neighbor_num = cells[i, j-1] + cells[i, j+1] + cells[i+1, j] + cells[i-1, j] +\
              cells[i-1, j-1] + cells[i-1, j+1] +\
              cells[i+1, j-1] + cells[i+1, j+1]
      
      if neighbor_num == 3:
        buf[i, j] = 1
      elif neighbor_num == 2:
        buf[i, j] = cells[i, j]
      else:
        buf[i, j] = 0
  return buf

update_state_c 函数上的两个装饰器是用来关闭 Cython 的边界检查的。

在同文件下新建一个 setup.py 文件

import numpy as np
from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize

setup(
  name="Cython Update State",
  ext_modules=cythonize("update.pyx"),
  include_dirs=[np.get_include()]
)

因为在 Cython 文件中使用了 NumPy 的头文件,所以我们需要在 setup.py 将其包含进去。

执行 python setup.py build_ext --inplace 后,同文件夹下会生成一个 update.cp36-win_amd64.pyd 的文件,这就是编译好的 C 扩展。

我们修改原始的代码,首先在文件头部加入 import update as cupdate,然后修改更新方法如下

def update_state(self):
  """更新一次状态"""
  self.cells = cupdate.update_state(self.cells)
  self.timer += 1

将原方法名就改为 update_state_py 即可,运行脚本,无异常。

测速

我们编写一个方法来测试一下使用 Cython 可以带来多少速度的提升

def test_time():
  import time
  game = GameOfLife(cells_shape=(60, 60))
  t1 = time.time()
  for _ in range(300):
    game.update_state()
  t2 = time.time()
  print("Cython Use Time:", t2 - t1)
  del game
  game = GameOfLife(cells_shape=(60, 60))
  t1 = time.time()
  for _ in range(300):
    game.update_state_py()
  t2 = time.time()
  print("Native Python Use Time:", t2 - t1)

运行该方法,在我的电脑上输出如下

Cython Use Time: 0.007000446319580078
Native Python Use Time: 4.342248439788818

速度提升了 600 多倍。

以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

基于Python的文件类型和字符串详解

基于Python的文件类型和字符串详解

1. Python的文件类型 1. 源代码--直接由Python解析 vi 1.py #!/usr/bin/python print 'hello world' 这里的1.py...

在Django同1个页面中的多表单处理详解

在Django同1个页面中的多表单处理详解

快速上手Django实现项目 近期公司在做1个海淘的项目,APP为pylot。由于时间比较赶,加上隔壁那哥们不在,只能自己挑大梁了。结果,当项目做出来之后,被领导狠狠的批了一顿,说怎么用...

Python中用于检查英文字母大写的isupper()方法

 isupper()方法检查字符串的所有基于大小写的字符(字母)是否是大写。 语法 以下是isupper()方法的语法: str.isupper() 参数 &n...

python hough变换检测直线的实现方法

python hough变换检测直线的实现方法

1 原理  2 检测步骤 将参数空间(ρ,θ) 量化成m*n(m为ρ的等份数,n为θ的等份数)个单元,并设置累加器矩阵,初始值为0; 对图像边界上的每一个点(x,y)带入ρ=...

解决Mac下首次安装pycharm无project interpreter的问题

Pycharm本身并不带编译器,所以第一次用需要自己下载编译器插件。 1、首先去 https://www.python.org/downloads/ 这个网址去下载对应的python版本...