python 将dicom图片转换成jpg图片的实例

yipeiwu_com6年前Python基础

主要原理:调整dicom的窗宽,使之各个像素点上的灰度值缩放至[0,255]范围内。

使用到的python库:SimpleITK

下面是一个将dicom(.dcm)图片转换成jpg图片的demo:

import SimpleITK as sitk
import numpy as np
import cv2

def convert_from_dicom_to_jpg(img,low_window,high_window,save_path):
  lungwin = np.array([low_window*1.,high_window*1.])
  newimg = (img-lungwin[0])/(lungwin[1]-lungwin[0])  #归一化
  newimg = (newimg*255).astype('uint8')        #将像素值扩展到[0,255]
  cv2.imwrite(save_path, newimg, [int(cv2.IMWRITE_JPEG_QUALITY), 100])

if __name__ == '__main__':

  # 下面是将对应的dicom格式的图片转成jpg
  dcm_image_path = '/DICOM_image/lung001.dcm'    #读取dicom文件
  output_jpg_path = 'JPG_image/lung001.jpg'
  ds_array = sitk.ReadImage(dcm_image_path)     #读取dicom文件的相关信息
  img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds_array)   #获取array
  # SimpleITK读取的图像数据的坐标顺序为zyx,即从多少张切片到单张切片的宽和高,此处我们读取单张,因此img_array的shape
  #类似于 (1,height,width)的形式
  shape = img_array.shape
  img_array = np.reshape(img_array, (shape[1], shape[2])) #获取array中的height和width
  high = np.max(img_array)
  low = np.min(img_array)
  convert_from_dicom_to_jpg(img_array, low, high, output_jpg_path)  #调用函数,转换成jpg文件并保存到对应的路径
  print('FINISHED')

以上这篇python 将dicom图片转换成jpg图片的实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

Python中实现参数类型检查的简单方法

Python是一门弱类型语言,很多从C/C++转过来的朋友起初不是很适应。比如,在声明一个函数时,不能指定参数的类型。用C做类比,那就是所有参数都是void*类型!void类型强制转换在...

pandas通过字典生成dataframe的方法步骤

1、将一个字典输入: 该字典必须满足:value是一个list类型的元素,且每一个key对应的value长度都相同: (以该字典的key为columns) >>>...

Python实现自动为照片添加日期并分类的方法

Python实现自动为照片添加日期并分类的方法

本文实例讲述了Python实现自动为照片添加日期并分类的方法。分享给大家供大家参考,具体如下: 小时候没怎么照相,所以跟别人说小时候特别帅他们都不信。小外甥女出生了,我给买了个照相机,让...

python绘制已知点的坐标的直线实例

如下所示: import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np x = [11422,11360,11312,112...

对python中的xlsxwriter库简单分析

一、xlsxwriter 基本用法,创建 xlsx 文件并添加数据 官方文档:http://xlsxwriter.readthedocs.org/ xlsxwriter 可以操作 xls...